超期未认证的发票虽然可以入账，但是不允许抵扣进项税额。对于增值税专用发票过期未认证的情况，国家有明确的规定。即增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票和机动车销售统一发票，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。另外，相关文件还规定，增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票、机动车销售统一发票以及海关缴款书，未在规定期限内到税务机关办理认证、申报抵扣或者申请稽核比对的，不得作为合法的增值税扣税凭证，不得计算抵扣进项税额。同时，购货方不可以将发票退回，销货方也不可以将发票作废或冲红后重新开具。